本校始創於民國十八年四月十七日，初名「私立家政裁縫講習所」專授女子家政縫紉技藝，所址設於本市東門路彌陀寺內，由王兆麟先生擔任所長。廿一年四月改稱「私立台南家政女學校」，為三年制家事職校。廿一年十一月由前「台南州廳」撥付本校現有土地之一部份。翌年建竣校舍，不幸於廿五年十一月遭回祿之殃，校舍幾至全毀，廿六年元月再行重建。

　　卅四年本省光復，翌年奉台南市政府令組織董事會接收本校，推選劉明哲先生為首任董事長，韓石泉先生為第一任校長，俟董事會成立並完成接交，本校更名為「私立光華女子初級中學」。卅六年韓石泉先生轉任為董事長，聘請劉快治女士接掌校務，卅九年一月劉校長辭職，遴聘林澄藻先生繼任，四十年二月林校長因兼職繁忙請辭，聘請李嘉嵩先生繼任，四十年九月李校長患病休養，暫請本校常務董事兼教師商滿生先生代理校務，四十一年七月正式聘任為校長。四十四年七月奉准增設高中部，四十七年成立財團法人，四十八年七月商校長因病辭職，特聘為名譽校長。

　　本校跟隨潮流、發展資訊教育，於七十一年成立電子計算機中心，並於八十年以「光明繪圖軟體」榮獲中華民國首屆傑出資訊應用獎－本校是唯一獲獎的學校。又配合市府開闢慶東街及充實室內布置科設備，特興建「尚美樓」，於七十五年四月啟用。光華樓則於七十九年四月落成。唯令人遺憾的是以校為家、建樹良多的許興仁校長卻於八十二年十月卅日因心臟病發不幸辭世。董事會乃遴聘台南市教育會理事長葉瑞山先生膺任本校第八任校長。

　　葉校長重視全人教育理念，上任之後即大力提倡「第二專長教育」，成效斐然，並榮獲評鑑特優；八十四年五月，在其極力爭取下，又因辦學績優，榮獲教育廳准予恢復國中部，並增設國中技藝教育之室內設計班及服裝設計班，至此國中、高中、高職三體制並進，以期未來朝更理想之中學而努力。至於校園環境建設，更是克服各種難關大力推展，在八十四學年度完成操場翻修、ＰＵ跑道鋪置、學生廁所改建，加強校園美化綠化及充實教學儀器。八十七學年度與逢甲大學合辦大學學分班，順利展開大學推廣教育。此外教育部指定本校設置「教材資源中心」，因四年來成績優良，奉教育部核定為特優。八十九年七月光華堂拆除重建。值此，葉校長因年屆退休向董事會提出辭呈，經董事會決議改聘為名譽校長，敦請高雄醫學大學心理學系副教授郭乃文博士繼任第九任校長。

　　郭校長於民國九十年五月一日接任，隨即推動校內各委員會成立，讓教師皆有參與校務行政的機會。九十年五月校友會成立，凝聚校友共識，由舞蹈家廖末喜女士榮獲推選為第一屆會長；六月校園義工團成立；另對外積極尋求其他高中職校園的合作夥伴，作跨校的選課與資源共享，九十學年度成為台南市第一個「高中職社區化」專案（鳳凰城學園）的召集學校。另一方面，積極籌畫培養學生之自治、自省以及全人生涯之軟硬體教育環境，成立學生自治會，並開辦體育專長及學術專長選修、制服多樣化、營養午餐、夜宿活動、女子書房、心靈網咖等。同時，在資訊教育方面，九十年六月起成為台南市唯一丙級技術士技能檢定「定期定點即測即評」學科測驗合格考場；經多次評鑑，獲教育部指定為全國唯一國中數學、家政、鄉土教材的「學習加油站」網站負責學校；辦理台南市第一屆「分領域學科查資料比賽」；並獲教育部補助設協助國中小資訊發展服務隊。九十一年三月新綜合教學大樓「良誠樓」落成。九十一學年度起開辦「綜合高中」，九十三年經教育部評鑑為嘉南地區第一名，全國第九名。此外，改建學生宿舍及車庫，啟動「綠校園」改造計畫，興建沐華樓、生態水池，鋪設明心池畔透水磚，並增設噴水造景及光華樓中庭美化設計，校園煥然一新。旋於九十三、九十四年榮獲「綠色學校」掛牌之殊榮，全國唯一獲頒特優獎之高中職永續校園；九十五年榮獲教育部評為友善校園學生事務及輔導工作績優學校，台南鳳凰Z CLUB創社，成立鄉土自然教室陳列館，申請「教師專業發展評鑑」計畫通過，榮獲縮減城鄉數位落差資訊志工團隊計畫「傑出團隊獎」，台灣燈會高中職校組特優(燈王) 、社會組特優；九十六年又獲評品德教育績優學校，台灣燈會國小幼稚園組特優(燈王) 、國中組、高中職組及社會組特優，綜合高中評鑑特優(全國最高分)，隨即出書「前額葉學校」記錄改革之理念與歷程，並為校園定位。九十六學年度更榮獲高中校務評鑑一等獎，多元智慧實驗班特優，獲創意教學環境計畫與國科會科學教育處高瞻計畫等。九十七年榮獲台灣燈會高中職組特優(燈王) ，國中組及社會大專組特優，全國高職相關創造力績優學生社團優等(美術創意社)， 並推出科學的生命教育－「環境身心課程」與「自我身心課程」 (全國首創)；郭校長且於九十七年榮獲教育部頒全國校長卓越領導獎，然因郭校長尚有其學術及專業領域之重責，乃轉任成功大學教職。故董事會於九十七學年度改聘郭乃文博士為首席諮議，敦請官茂良先生繼任第十任校長。